Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CFAP47Q6ZTR5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP47Q6ZTR5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP47Q6ZTR5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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