Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBM43Q6ZSC3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM43Q6ZSC3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM43Q6ZSC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM43Q6ZSC3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM43Q6ZSC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM43Q6ZSC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM43Q6ZSC3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms