Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms