Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CD109Q6YHK3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD109Q6YHK3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms