Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC171Q6TFL3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC171Q6TFL3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms