Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE2Q6PIF2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms