Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND1BQ6P3S1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms