Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms