Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP1R18Q6NYC8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms