Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54Q6NXT1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms