Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF40BQ6NWY9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms