Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms