Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms