Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL1Q5VZK9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CARMIL1Q5VZK9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL1Q5VZK9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms