Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms