Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SUSD4Q5VX71 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms