Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GKAP1Q5VSY0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms