Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRIP1Q5VSL9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms