Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH4AQ5TD94 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms