Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN11Q5T124 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms