Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms