Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTH9

RRP12, RRP12-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP12Q5JTH9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP12Q5JTH9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP12Q5JTH9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms