Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFDP3Q5H9I0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms