Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD12Q587J7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms