Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms