Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL3Q4VX76 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYTL3Q4VX76 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms