Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms