Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PROX2Q3B8N5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PROX2Q3B8N5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROX2Q3B8N5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROX2Q3B8N5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROX2Q3B8N5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms