Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKOR2Q2VWA4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKOR2Q2VWA4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKOR2Q2VWA4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKOR2Q2VWA4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKOR2Q2VWA4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR2Q2VWA4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR2Q2VWA4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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