Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms