Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PPP1R3AQ16821 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R3AQ16821 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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PPP1R3AQ16821 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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