Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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