Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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