Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FXNQ16595 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FXNQ16595 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FXNQ16595 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FXNQ16595 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FXNQ16595 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FXNQ16595 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FXNQ16595 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FXNQ16595 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FXNQ16595 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FXNQ16595 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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FXNQ16595 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FXNQ16595 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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FXNQ16595 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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FXNQ16595 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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FXNQ16595 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FXNQ16595 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FXNQ16595 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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