Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDB1Q16531 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDB1Q16531 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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