Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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