Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX2Q16385 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms