Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NPTX1Q15818 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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