Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

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Length 3,267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPEGQ15772 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms