Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATXN8Q156A1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATXN8Q156A1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms