Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms