Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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