Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
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