Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN2CQ14957 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2CQ14957 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms