Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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