Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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