Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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