Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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