Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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