Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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